Infecţia cu virusul West Nile poate fi lipsită de simptome. Dar mulţi se îmbolnăvesc de febra West Nile ori de boala neuroinvazivă (o formă severă a bolii, care include encefalita West Nile ori meningite ori poliomielite West Nile). 4 din 5 persoane infectate cu virusul West Nile nu dezvoltă nicio boală.
20% dintre cei care sunt infectaţi se vor îmbolnăvi de febra West Nile. Simptomele sunt următoarele: febră, dureri de cap, stare de oboseală accentuată şi dureri organice. Boala se vindecă în câteva zile ori câteva săptămâni.
Simptomele bolii neuroinvazive sunt: dureri de cap, febră mare, dezorientare, comă, convulsii, paralizie etc. Circa 1 din 150 de persoane infectate cu virusul West Nile va dezvolta această formă severă de manifestare maladivă.